De acuerdo con los resultados podemos inferir que las proteínas HSP90 tienen su expresión aumentada, en aves contaminadas con pesticidas organoclo rados, favoreciendo la interacción entre ESRI y DDT / TCDD. El estudio de centralidad apuntó a ESR1 y HSP90AB1 como los hubs-bottle- neck proteínas que estaban involucradas en la vía de recepción de estrógeno y en el transporte de calcio. El análisis de clusterización indicó 4 clusters, siendo que el análisis y ontología génica apuntó procesos biológicos ligados a la señalización y al desarrollo morfológico. La red resultante presentó 137 nudos y 1.417 interacciones. En la red resultante se analizaron la clusterización, la ontología génica y la centralidad. Las subredes encontradas fueron aumentadas en 100 interacciones en la plataforma STRING 10.5 y unidas por la herramienta Merge del programa Cytoscape 3.4.0, usando el modelo experimental Gallus gallus. Estos fue ron prospectos en la plataforma STITCH 5.0. A través de una revisión bibliográfica se incluyeron dos compuestos, DDT y TCDD. El objetivo de este trabajo fue, a través de herramientas de biología de sistemas, comprender cómo los organoclorados actúan en el organismo de las aves. Pesticidas como el DDT, causan biomagnificación en las aves, afectando las cáscaras de los huevos y dañando su desarrollo. Keywords: Ligand-protein network OPIN network Eggshell Birds of prey PesticidesĮn los años 60, los organoclorados fueron responsables del declive de aves de rapiña como Haliaeetus leucocephalus y Falco peregrinus. Therefore, the relationship between the HSP90 protein expression and thin-shell syndrome was identified for the first time in this in silico study. The presence or absence of heat shock proteins, such as HSP90, influences several aspects of reproduction in many species. Therefore, it is possible that HSP90 proteins have increased expression in birds contaminated with organochlorine pesticides, favoring ESRI-organochlorines interaction and disturbing the calcium availability related to the eggshell formation. The centrality analysis indicated ESR1 and HSP90AB1 as hub/bottleneck proteins involved in the estrogen pathway and calcium transport. The clusterization indicated four clusters and the gene ontology pointed to biological processes related to cell signaling and morphological development. The resulting network had 1,417 interactions and 137 nodes. Clusterization, gene ontology, and centrality were the parameters evaluated in the resulting network. The sub-networks were amplified in 100 interactions in STRING 10.5 and joined by the Cytoscape 3.4.0 Merge software, using the experimental animal model Gallus gallus. We performed a literature review, using the STITCH 5.0 platform, searching for the terms DDT and TCDD. Using system biology tools, the goal of this study was to better comprehend how organochlorines act on birds. Pesticides similar to DDT cause bioaccumulation in birds, affecting their eggshell com- position and compromising their development. In the 1960s, organochlorine compounds were responsible for the decline of birds of prey populations such as Haliaee- tus leucocephalus and Falco peregrinus.
0 Comments
Leave a Reply. |
AuthorWrite something about yourself. No need to be fancy, just an overview. ArchivesCategories |